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  • 17.09 謝巧慧同學和黃振綜同學分別榮獲 The travel grant award of the 76th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 17.08 陳卓逸博士獲聘國立陽明大學生醫資訊所助理教授
  • 17.08 許家郎博士獲聘臺大醫院醫學研究部專案助理研究員
  • 17.08 張海妍同學研究成果獲得2017 Cascadia Proteomics Symposium海報比賽第三名
  • 17.05 鍾昀憲同學榮獲105學年度生命科學系論文壁報競賽優等
  • 17.04 張心儀博士獲聘日本京都大學藥學院助理教授
  • 17.03 黃鼎育和鍾昀憲分別榮獲第三十二屆生物醫學聯合學術年會優秀論文壁報獎
  • 17.03 柯逵悅同學獲哈佛大學 Computational Biology and Quantitative Analysis 和杜克大學碩士班入學許可
  • 16.10 張海妍同學和許家郎博士分別榮獲 The travel grant award of the 75th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 16.05 林采羭同學榮獲104學年度生命科學系論文壁報競賽佳作
  • 16.03 王薇瑄和侯君里榮獲第三十一屆生物醫學聯合學術年會優秀論文壁報獎
  • 16.03 林采羭和陳允芃分別榮獲BIT2016暨陽明九州生醫資訊與生物科技研討會海報競賽第一名和第三名
  • 15.12 阮雪芬老師榮獲 2015 The Emerging Information and Technology Association (EITA) Service Award (USA)
  • 15.12 博士生黃振綜同學榮獲台灣大學生醫電資所第五屆學生傑出論文獎
  • 15.11 博士生張海妍同學榮獲2015台灣蛋白體年會暨轉譯與系統生物學研討會最佳海報獎
  • 15.11 許家郎博士榮獲2015 Asia-Pacific Symposium of Neuroblastoma Best Poster Award
  • 15.10 黃振綜同學榮獲 The travel grant of the 74th Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • 15.06 陳瑋庭同學榮獲生命科學系博碩士班103學年度論文壁報競賽優等
  • 15.06 崔昭胤同學榮獲分子與細胞生物學研究所103學年度論文壁報競賽佳作
  • 15.05 碩士班陳瑋庭同學當選中華民國斐陶斐榮譽學會104年度榮譽會員
  • 15.04 Dr. James Winkler 獲得 Fulbright Foreign Student Program Fellowship, 即將於2015年秋季開始到實驗室訪問研究
  • 15.04 張心儀博士獲聘日本京都大學藥學院博士後研究員
  • 15.03 高士傑, 郭子霆, 陳瑋庭同學各榮獲第三十屆生物醫學聯合學術年會優秀論文壁報獎
  • 15.03 陳龍輝同學獲史丹福(Stanford)大學電腦科學系碩士班入學許可
  • 15.03 吳怡萱同學獲University of Florida 的博士班全額獎學金, Michigan State University 和 Johns Hopkins University 碩士班入學許可
  • 15.02 2012博士畢業生林振慶獲聘為國立陽明大學生醫資訊研究所助理教授
  • 15.01 陳卓逸博士獲聘為Harvard Medical School Dana-Farber Cancer Institute 博士後研究員
  • 15.01 陳卓逸同學通過博士論文口試
  • 15.01 張心儀博士榮獲日本學術振興會外國人特別研究員獎助 (JSPS Fellowship)

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Research Highlights


系統生物學是生物學上一個新興的領域,它著重於以系統的觀點來了解生物系統的運作。由於高通量藥物合成、蛋白質體、微陣列、次世代定序及生物資訊技術的發展,使得系統生物學的研究愈發可行了。生物轉變的整體研究將能加快闡明生化路徑及疾病治療的速度。除此之外,系統生物學也著重於描述和了解複雜的生物系統如何運作以及發展預測人類疾病的模式。雖然疾病生物學很複雜,而藥物開發則必需倚靠生物反應,但是“基因到藥物”的希望之路已經是一觸即發,即將成功。對於改善現行的癌症治療,如何使藥物能專一地作用在癌細胞上仍然是一個主要的挑戰。

ATP 合成酶是細胞中重要的酵素,它能產生「能量貨幣分子」—ATP。Paul D. Boyer和John E. Walker因為釐清ATP合成的酵素機制而在1997年獲頒諾貝爾化學獎。長時間以來,ATP 合成酶一直被認為只出現在動物的粒線體內膜上,然而愈來愈多的證據顯示ATP 合成酶也會表現在癌組織的表皮細胞、乳癌及肺癌細胞的細胞膜上,這一類的ATP 合成酶被稱作「細胞膜異位表達ATP合成酶」。除了我們在2008年、2012年及2014年分別發表於Journal of Proteome Research、Cancer Research及Cell Death & Disease的文章中,證明阻斷細胞膜異位表達ATP合成酶的活性可以有效地抑制癌細胞生長外,也有許多報導指出細胞膜異位表達ATP合成酶具有可當作抗腫瘤及抑制血管新生藥物標靶的潛力。細胞膜異位表達ATP合成酶是一個重要的蛋白質,但是它為何出現在細胞膜? 以及它在細胞膜上的功能為何? 目前仍不是很清楚。因此本實驗室期望運用系統生物學研究方法探討細胞膜異位表達ATP合成酶的反應路徑及其在癌症進程上所扮演的角色。

微型RNA (microRNA) 是在植物、動物及某些病毒中發現的,它非常小 (~22鹼基對) 而且是non-coding調控性的RNA分子,愈來愈多研究顯示它與癌症的發生息息相關。自2002年以來發現它在癌症發生上所扮演的角色,已經有非常多的學者投入這個行列,使得它與癌症的研究變成是一個愈發重要的課題。它可以調控非常多的蛋白質(幾十個甚或幾百個),這些被它調控的蛋白質間是否有一個重要的交互作用網路出現呢? 它們的改變又是如何使正常細胞轉變成癌細胞的呢? 這也是本實驗室目前的研究主題之一。

神經母細胞瘤(neuroblastoma;簡稱NB)是兒童最常見的頭外固態腫瘤,其中約20–25%帶有MYCN致癌基因放大現象。MYCN癌蛋白為Myc轉錄因子家族的一員,帶有MYCN基因放大的腫瘤屬於極高危險群,儘管經過多科整合治療,預後仍極為不佳。最近研究發現,某些microRNAs(微小的non-coding RNA,簡稱miRNAs)在NB腫瘤生成與疾病惡化的過程中扮演重要角色。因此,若能深入探討MYCN與miRNA間的調控網路,可更加了解NB的致病機轉,並有機會找到新的治療標靶。本實驗室目前的研究重點之一為探討神經母細胞瘤MYCN癌蛋白所驅動之miRNA調控網路,並進而利用分子模擬和對接模擬尋找新的抗神經母細胞瘤藥物。

Research Projects


1. 結合蛋白質體學和網路生物學研究細胞膜異位表達ATP合成酶的反應路徑
Elucidating the response pathways of ectopic ATP synthase by combining proteomics and network biology

2. 以蛋白體學探討ATP合成酶如何透過胞外囊泡進行細胞與細胞間的溝通
Role of ectopic ATP synthase in cell-cell communications mediated by extracellular vesicles

3. 重定位藥物探索於神經母細胞瘤治療: 反應機制研究
Drug repositioning for neuroblastoma therapy: investigation of the mechanism of action

4. 以系統生物學探索神經母細胞瘤中重要的長鏈非編碼核糖核酸
Systems biology approach for key lncRNAs in neuroblastoma